產(chǎn)品目錄

產(chǎn)品名稱(chēng)	英文名稱(chēng)	規(guī)格	貨號(hào)
革蘭氏陽(yáng)性菌基因組DNA提取試劑盒	Genomic DNA extraction kit for Gram-positive bacteria	50T\|100T	CS-01F99080

本試劑盒采用可以特異性結(jié)合DNA的離心吸附柱和獨(dú)特的緩沖液系統(tǒng)，提取革蘭氏陽(yáng)性菌基因組DNA。離心吸附柱中采用的硅基質(zhì)材料為本公司特有新型材料，能夠高效專(zhuān)一吸附DNA，可最大限度去除雜質(zhì)蛋白及細(xì)胞中其他有機(jī)化合物。提取的基因組DNA片段大，純度高，質(zhì)量穩(wěn)定可靠。使用本試劑盒提取的基因組DNA可用于各種常規(guī)操作，包括酶切、 PCR、文庫(kù)構(gòu)建、Southern雜交等實(shí)驗(yàn)。

儲(chǔ)存條件：15～25℃干燥保存，有效期12個(gè)月，2℃-8℃保存時(shí)間更長(zhǎng)。

操作步驟：

使用前請(qǐng)先在漂洗液中加入無(wú)水乙醇，加入體積請(qǐng)參照瓶體上的標(biāo)簽。所有離心步驟均為使用臺(tái)式離心機(jī)在室溫下離心。

1．取細(xì)菌培養(yǎng)液1ml，12000rpm 離心1min.，盡量吸除上清。

2．向菌體中加入200μl終濃度為20mg/ml的溶菌酶，用溶菌酶干粉加入緩沖液20mM Tris(pH8.0)；2mM Na2-EDTA；1.2% Triton X-100，37℃處理30min以上。(如果需要去除RNA，可加入20μl RNase A,100mg/ml溶液)

3．向菌體中加入200μl溶液A，振蕩或用移液器吹打使菌體充分懸浮，向懸浮液中加入20μl的RNase A(10mg/ml)和50ul溶菌酶，充分顛倒混勻，室溫放置30～60min。(可選作，如做第3步操作，可以將第2步離心后的沉淀用于后續(xù)實(shí)驗(yàn))。

4．向管中加入20μl的蛋白酶K(10mg/ml)，充分混勻，55℃消化30～60min，消化期間可顛倒離心管混勻數(shù)次，直至樣品消化完全為止，此時(shí)可見(jiàn)菌液呈清亮粘稠狀。

5．向管中加入200μl溶液B，充分顛倒混勻，如出現(xiàn)白色沉淀，可于75℃放置15～30min，沉淀即會(huì)消失，不影響后續(xù)實(shí)驗(yàn)。如果溶液未變清亮，說(shuō)明樣品消化不徹底，可能會(huì)導(dǎo)致 DNA的提取量以及純度降低，還可能堵塞吸附柱。

6．向管中加入200μl無(wú)水乙醇，充分混勻，此時(shí)還可能會(huì)出現(xiàn)絮狀沉淀，不影響DNA的提取，可將溶液和絮狀沉淀都加入到吸附柱中，靜置2min。

7．12000rpm離心2min. 棄廢液，將吸附柱放入收集管中。

8．向吸附柱中加入600μl漂洗液(使用前請(qǐng)先檢查是否己加入無(wú)水乙醇)。12000rpm 離心1min，棄廢液，將吸附柱放入收集管中。

9．向吸附柱中加入600μl漂洗液，12000rpm離心lmin，棄廢液，將吸附柱放入收集管中。

10．12000rpm離心2min，將吸附柱敞口置于室溫或50℃溫箱放置數(shù)分鐘，目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除，否則漂洗液中的乙醇會(huì)影響后續(xù)實(shí)驗(yàn)如酶切、PCR等。

11．將吸附柱放入一個(gè)干凈的離心管中，向吸附膜中央懸空滴加 50～200μl經(jīng)65℃水浴預(yù)熱的洗脫液，室溫放置5min，12000rpm離心1min。

12．離心所得洗脫液再加入吸附柱中，室溫放置2min，12000rpm 離心2min，即可得到高質(zhì)量的細(xì)菌基因組DNA。

注意事項(xiàng):

1．樣品應(yīng)避免反復(fù)凍融，否則會(huì)導(dǎo)致提取的DNA片段較小且提取量下降。

2．若試劑盒中的溶液出現(xiàn)沉淀，可在65℃水浴中重新溶解后再使用，不影響提取效果。

3．如果實(shí)驗(yàn)中的離心步驟出現(xiàn)柱子堵塞的情況，可適當(dāng)延長(zhǎng)離心時(shí)間。

4．洗脫緩沖液的體積最好不少于50μl，體積過(guò)小會(huì)影響回收效率；洗脫液的pH值對(duì)洗脫效率也有影響，若需要用水做洗脫液應(yīng)保證其pH值在8.0左右(可用NaOH將水的pH值調(diào)至此范圍)，pH值低于7.0會(huì)降低洗脫效率。DNA產(chǎn)物應(yīng)保存在-20℃，以防DNA降解。
5．DNA濃度及純度檢測(cè)：得到的基因組DNA片段的大小與樣品保存時(shí)間、操作過(guò)程中的剪切力等因素有關(guān)?；厥盏玫降?/span>DNA片段可用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計(jì)檢測(cè)濃度與純度。DNA應(yīng)在OD260處有顯著吸收峰，OD260值為1.0相當(dāng)于大約50μg/ml雙鏈DNA、40μg/ml單鏈DNA。OD260/0D280比值應(yīng)為1.7～1.9，如果洗脫時(shí)不使用洗脫緩沖液，而使用去離子水，比值會(huì)偏低，因?yàn)?/span>pH值和離子存在會(huì)影響光吸收值，但并不表示純度低。

實(shí)驗(yàn)步驟：

(1)實(shí)驗(yàn)開(kāi)始前將RNA提取液于65℃水浴鍋中預(yù)熱,離心管中加入ME(巰基乙醇),(10mL加80ul,50mL中加入300ul)

(2)取約0.8g菌絲體(液體培養(yǎng)獲得的菌絲用真空抽濾即可！固體培養(yǎng)就更好說(shuō)了),在液氮中迅速磨成精細(xì)粉末,裝入50mL離心管,按1g材料8mL的量加入預(yù)熱的RNA提取液,顛倒混勻

(3)65℃水浴3-10 min,期間混勻2-3次

(4)加入等體積的酚(注意是酸酚pH4.5)::異戊醇(25:24:1)抽提(10,000rpm,4℃,5 min)

(5)取上清,等體積的:異戊醇(24:1)抽提(10,000rpm,4℃,5 min)

(6)加入1/4V體積10M LiCl溶液,4℃放置6h以上(或過(guò)夜)

(7)10,000rpm,4℃離心20min

(8)棄上清,用500ul SSTE溶解沉淀

(9)酚::異戊醇(25:24:1)抽提兩次,:異戊醇(24:1)抽提1次(10,000rpm,4℃,5min)

(10)加2V體積的無(wú)水乙醇,在-70℃冰箱沉淀30min以上

(11)12,000rpm,4℃離心20 min

(12)棄上清.沉淀用70%酒精漂洗一次,干燥

(13)加200ul的DEPC處理水溶解

(14)用非變性瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計(jì)掃描檢測(cè)RNA的質(zhì)量

(在抽提過(guò)程中,若蛋白質(zhì)含量或其它的雜質(zhì)還較多,可以增加抽提次數(shù))

操作步驟:

1. 勻漿處理:a.組織將組織在液氮中磨碎,每50-100mg組織加入1ml TRIzol,用勻漿儀進(jìn)行勻漿處理。樣品體積不應(yīng)超過(guò)TRIzol體積10℅。

b.單層培養(yǎng)細(xì)胞直接在培養(yǎng)板中加入TRIzol裂解細(xì)胞，每10cm2面積(即3.5cm直徑的培養(yǎng)板)加1ml，用移液器吸打幾次。TRIzol的用量應(yīng)根據(jù)培養(yǎng)板面積而定，不取決于細(xì)胞數(shù)。TRIzol加量不足可能導(dǎo)致提取的RNA有DNA污染。

c．細(xì)胞懸液離心收集細(xì)胞，每5-10×106動(dòng)物、植物、酵母細(xì)胞或1×107細(xì)菌細(xì)胞加入1ml TRIzol，反復(fù)吸打。加TRIzol之前不要洗滌細(xì)胞以免mRNA降解。一些酵母和細(xì)菌細(xì)胞需用勻漿儀處理。產(chǎn)品僅用于科研

2．將勻漿樣品在室溫（15-30℃）放置5分鐘，使核酸蛋白復(fù)合物完全分離。

3．可選步驟：如樣品中含有較多蛋白質(zhì)，脂肪，多糖或胞外物質(zhì)（肌肉，植物結(jié)節(jié)部分等）可于2-8℃10000×g離心10分鐘，取上清。離心得到的沉淀中包括細(xì)胞外膜，多糖，高分子量DNA，上清中含有RNA。處理脂肪組織時(shí)，上層有大量油脂應(yīng)去除。取澄清的勻漿液進(jìn)行下一步操作。

5. 每使用1ml TRIzol加入0.2ml，劇烈振蕩15秒，室溫放置3分鐘。

6. 2-8℃10000×g離心15分鐘。樣品分為三層：底層為黃色有機(jī)相，上層為無(wú)色水相和一個(gè)中間層。RNA主要在水相中，水相體積約為所用TRIzol試劑的60℅。

7. 把水相轉(zhuǎn)移到新管中，如要分離DNA和蛋白質(zhì)可保留有機(jī)相，進(jìn)一步操作見(jiàn)后。用異丙醇沉淀水相中的RNA。每使用1ml TRIzol加入0.5ml異丙醇，室溫放置10分鐘。

8. 2-8℃10000×g離心10分鐘，離心前看不出RNA沉淀，離心后在管側(cè)和管底出現(xiàn)膠狀沉淀。移去上清。

原創(chuàng)作者：上海莼試生物技術(shù)有限公司

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