1,先選擇好探針,然后設(shè)計(jì)引物使其盡可能的靠近于探針。
2, 擴(kuò)增子的長度應(yīng)不超過400bp,理想的能在100-150bp內(nèi),擴(kuò)增片斷約短,有效的擴(kuò)增反應(yīng)就越容易獲得。較短的擴(kuò)增片斷也容易保證分析的一致性
3, 保持GC含量在20%和80%之間,GC富含區(qū)容易產(chǎn)生非特異反應(yīng),從而會(huì)導(dǎo)致擴(kuò)增效率的降低,及在SG分析中非特異信號。
4, 為了保證效率和重復(fù)性,應(yīng)避免重復(fù)的核苷酸序列,尤其是G(不能有4個(gè)連續(xù)的G)
5, 將引物和探針互相進(jìn)行配對檢測,以避免二聚體和發(fā)卡結(jié)構(gòu)的形成。
1,在設(shè)計(jì)引物之前設(shè)計(jì)探針
2,探針的Tm值應(yīng)在68-70℃之間,如果是目測探針,則要仔細(xì)審查GC富含區(qū)。
3,探針的5’端要避免有鳥氨酸,5’G會(huì)有淬滅作用,即使被切割下來這種淬滅作用也還會(huì)存在
4,選擇C多于G的鏈作探針,G的含量多于C會(huì)降低反應(yīng)效率,這時(shí)就應(yīng)選擇配對的另一條鏈作為探針。
6, 探針應(yīng)盡可能的短,不要超過30個(gè)bp。
7, 檢測探針的DNA折疊和二級結(jié)構(gòu)。
全新的熱啟動(dòng)DNA聚合酶-Hot Start Taq DNA聚合酶,可在PCR反應(yīng)的過程中抑制非特異擴(kuò)增,從而最大限度地減少非特異性擴(kuò)增產(chǎn)物的產(chǎn)生,提高熒光定量PCR反應(yīng)的特異性;
采用新型的熒光染料EvaGreen,與傳統(tǒng)熒光染料相比,對PCR反應(yīng)抑制更小,而且熒光信號更強(qiáng),檢測靈敏度更高;
含有UNG的試劑盒可以防止PCR產(chǎn)物污染體系,進(jìn)而有效防止實(shí)驗(yàn)過程中PCR產(chǎn)物的交叉污染;
TaqMan熒光定量PCR試劑盒提供了除引物、探針、模板外的所有實(shí)驗(yàn)所需組分,并配備2×Buffer,可完成不同類型熒光探針的實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng),方便用戶使用;
原創(chuàng)作者:上海莼試生物技術(shù)有限公司